La biopsie liquide se compare à la biopsie tissulaire

Une étude présentée en amont du congrès de l’AACR met en évidence la concordance entre un test sur ADN circulant et la biopsie tissulaire pour l’identification des anomalies génétiques dans les cancers du poumon non à petites cellules (CPNPC). Il ne faudrait toutefois pas conclure hâtivement que la biopsie liquide pourrait se substituer totalement à la biopsie tissulaire.

photo credit : phanieZoom

Proposer des thérapies ciblées aux patients atteints de CPNPC suppose d’avoir identifié les potentielles altérations génétiques dans les cellules tumorales. Le Guardant360 de Guardant Health est un test pratiqué sur l’ADN circulant à la recherche de mutations sur les gènes EGFR, ALK, ROS1, BRAF, RET, MET, HER2, NTRK, et d’un biomarqueur pronostique, les mutations sur KRAS. Disponible depuis environ 2 ans, c’est un test très performant, très utilisé par certaines équipes en particulier aux États-Unis et en Grande-Bretagne dans les CPNPC en phase métastatique ou dans la détection précoce des cancers. Autres arguments en faveur de la biopsie liquide, son caractère non invasif et la rapidité d’obtention des résultats.

Une détection des anomalies génétiques en 9 jours

Présentée en amont du congrès de l’AACR, l’étude prospective multicentrique NILE (Noninvasive versus Invasive Lung Evaluation), menée chez 280 patients avec un CPNPC nouvellement diagnostiqué, montre la concordance entre le Guardant360 et la biopsie tissulaire pour la détection des anomalies géniques, avec des résultats obtenus en 9 jours au lieu de 15. Cette étude pourrait amener à conclure qu’un test sanguin bien validé, complet et sensible pourrait être une alternative aux biopsies tissulaires pour identifier les biomarqueurs prédictifs de la réponse thérapeutique aux thérapies ciblées. Une conclusion un peu rapide, puisque ces recherches ne concernent que les adénocarcinomes et non les épidermoïdes, et que, comme le reconnaît le Pr Vassiliki Papadimitrakopoulou, qui présentait l’étude, le Guardant360 est comparé à des tests tissulaires standards et non avec le NGS (Next-Generation Sequencing). « La comparaison porte sur deux approches qui ne sont pas identiques. Avec le NGS au niveau tissulaire, le délai de réponse peut aussi être de neuf jours », commente le Pr Hofman. « On manque aussi d’informations sur les tests utilisés pour les biopsies tissulaires, leur sensibilité et sur le type de biopsies réalisées ».

Biopsie liquide ou tissulaire ?

L’étude apporte des éléments nouveaux en montrant pour la première fois que pour les cibles thérapeutiques de l’EGFR, ALK, ROS1 et BRAF, ce test concorde avec la biopsie tissulaire avec une VPP de 100 % alors qu’on avait plutôt la notion de 65 % de VPP. Seules ces 4 altérations sont associées à un médicament ayant l’AMM, celles portant sur RET, MET et HER2 pourraient orienter vers un traitement qui n’a pas l’AMM actuellement dans les CPNPC. Par contre, la recherche de PDL1 et la charge tumorale mutationnelle qui doivent être recherchées dans les CPNBC ne peuvent l’être au mieux actuellement que sur les biopsies tissulaires, de même que l’amplification de MET ou les réarrangements de NTRK pour lesquels la biopsie tissulaire est bien plus sensible que l’ADN circulant. « C’est un travail très intéressant, mais qui porte sur une cohorte assez limitée, et il ne permet pas d’affirmer que la biopsie liquide va faire disparaître la biopsie tissulaire. Il faut attendre la présentation officielle de l’étude et les débats qu’elle ne manquera pas de susciter », tempère le pathologiste.

Actuellement, les tests sanguins sont intéressants lorsque les résultats de la biopsie tissulaire ne sont pas significatifs, que l’état général du patient ou la localisation de la tumeur la rendent impossible et ils ont surtout une place dans la surveillance des traitements afin de repérer l’apparition de mutations de résistance thérapeutique ou vérifier l’évolution de la quantité d’ADN libre circulant.

D’après un entretien avec le Pr Paul Hofman, pathologiste, CHU de Nice  
Papadimitrakopoulou V.A. (MD Anderson Cancer Center, Houston), « Clinical utility of comprehensive cell-free DNA (cfDNA) analysis to identify genomic biomarkers in newly diagnosed metastatic non-small cell lung cancer », conférence de Presse de présentation de l’AACR.

Source : Lequotidiendumedecin.fr

Appointment of Prof. Thierry Passeron as Deputy Director of the oncoage federation, he will head the new research axis dedicated to dermatology

Short biography of Thierry PASSERON, MD, PhD

Professor of Dermatology at the University Hospital of Nice. He also heads the laboratory INSERM U1065 team 12, C3M, dedicated to the study of molecular mechanisms involved in pigmentation and melanoma. He heads the University laser center in Nice. He is president of the Department of Clinical Research and Innovation of Nice University hospital and vice-president of Côte d’Azur University. He has seven international patents and more than 220 publications in scientific journals (h-index 41). He is co-founder of YUKIN therapeutics. His fields of research includes pigmentary disorders (including vitiligo and melasma), melanoma, hidradenitis suppurativa, alopecia areata and lasers.

Interview of Thierry Passeron:

  • What research, innovations or major advances in knowledge are you currently focusing on?

Skin cancers and melanoma in particular, have been the subject of major therapeutic advances in the past few years. Thus, targeted therapies and immunotherapy have for the first time significantly increased the overall survival of patients with metastatic melanoma. These treatments have recently been proposed as adjuvants, particularly after lymph node involvement.

Initially proposed for melanoma, immunotherapy is now available for many cancers. Unfortunately, full response rates are still insufficient. There is a lot of work being done at the moment to try to find predictive response factors on the one hand, but also to improve immunotherapy.

  • You are joining OncoAge to create a new Work Package, what do you expect from the federation?

We have always had close links with Professor Hofman’s Clinical and Experimental Pathology Laboratory (CEPL). The Dermatology department has the opportunity to work with 3 INSERM units dedicated to melanoma, one of which I co-lead. Thanks to the CEPA Tumour Library, we have been conducting translational research on our patients’ tissue and blood samples for several years. By joining the OncoAge federation we will be able to pool our resources and samples with other specialities such as pneumology for example. We will also be able to set up more ambitious research projects and respond to international calls for tenders. Finally, we have developed several agents in our research laboratories. One of them is the first NIK allosteric inhibitor. This kinase controls the non-canonical pathway of NFkB and plays a key role in most solid cancers by controlling the oncogene EZH2. By inhibiting NIK, it “warms” tumors and greatly enhances the response to immunotherapy (especially anti-PD1 Ac). We have very encouraging results in vitro but also on murine models in melanoma and colon cancer. Since May 2018 we have created with the Advent investment fund, the startup YUKUN therapeutics. Since April 2019, another partner (Medixci) has been a shareholder in order to bring our compounds into the clinical phase in humans. If we reach this stage, the clinical phase will be coordinated by our centre and the product can be tested on several cancers within the framework of the OncoAge federation.

  • Can links be made between oncology, aging and cancer in dermatology and other specialties through the exchanges that OncoAge allows with other research teams?

These links are naturally strong. In our region we see a large proportion of elderly patients. We check this every week in our multidisciplinary consultation meetings in oncodermatology. As the population ages, the number of older people who will be able to receive cancer treatment will increase and it is essential to conduct specific studies on this age group. Our federation must be in the front line to meet this challenge and propose institutional and industrial studies for this group of patients.

Collaboration MD Anderson- FHU OncoAge

OncoAge team organized the First Joint Meeting on Lung Cancer last September 2018, in Nice, at the Palais Sarde.

2 days of conferences, discussions between researcher from MD Anderson and OncoAge.

The goal of this collaboration is to make new promising discoveries for lung cancer patients.

At the meeting, high quality speakers from the MD Anderson and the FHU OncoAge, exchanged on the latest new treatments biomarkers and discoveries on lung cancer.

This year we have chosen to dedicate this meeting to lung cancer, but also some thoracic pre-neoplastic diseases, such as Chronic Obstructive Pulmonary Disease (COPD). Within this context, a partnership with research teams, scientists and physicians between the FHU OncoAge and the MD Anderson Cancer Center has been initiated.

Have a look to the video clip of the pasted event

  • 13 speakers : (G.Calin, V. Papadimitrakopoulou, J. Wang, S.Mani, S. Hanash, J. Heymach, I. Wistuba, D. Hong, P. Hofman, M. Ilie, J.Y. Blay, L. Yvan-Charvet, P. Saintigny)
  • 200 participants
  • 15 partners and sponsors (La Ligne contre le Cancer, Canceropôle, Roche, Abbvie, BMS, Astra Zeneca, Qiagen, UCA, MSD, CIUS, Métropole Nice, CHU Nice)

This partnership aims at working within the context of age-related lung cancer and non-tumor lung diseases as both age-related chronic diseases and cancer share genomic, immune, metabolic and other biological abnormalities.

In the future, there will be each year if possible, a Joint Meeting on Lung Cancer in Houston or in Nice.

Oncoage :

OncoAge is a Hospital-University Federation (FHU) dedicated to foster innovation for ageing population and Cancer management. It has been awarded in December 2015 by AVIESAN and it is supported by the Hospital University of Nice (CHU) and the Côte d’Azur University (UCA). OncoAge brings together the CHU of Nice, the Center Antoine Lacassagne (CAL), the Lenval Foundation, members of AVIESAN of the Côte d’Azur University, Léon Bérard Center (CLB) of Lyon, Gustave Roussy Institute of Villejuif, teams of research institutes IRCAN, IPMC, iBV, C3M, L2PM, Inria, the Department of Mathematics of the UCA. Through these teams the FHU involves INSERM, CNRS, Inria, CEA and UCA. These structures bring together their respective strengths in order to develop projects devoted to the development of care, research, innovation and education/training in the field of cancer and ageing. The University of Texas MD Anderson Cancer Center (MDACC) is one of the world’s most respected centers devoted exclusively to cancer patient care, research, education and prevention. The mission of The University of Texas MD Anderson Cancer Center is to eliminate cancer in Texas, the nation, and the world through outstanding programs that integrate patient care, research and prevention, and through education for undergraduate and graduate students, trainees, professionals, employees and the public. It shall be the premier cancer center in the world, based on the excellence of its people, their research-driven patient care and its science. //www.mdanderson.org/

Schizophrenia: Finding the best treatment

Schizophrenia: Finding the best treatment through a blood test, by Nicolas Glaichenhaus.

Nicolas Glaichenhaus de l’Institut de Pharmacologie Moléculaire et Cellulaire (UNS, CNRS) vient de recevoir le prix Marcel Dassault pour financer son projet de recherche sur les patients atteints de schizophrénie. Il espère ainsi pouvoir développer un algorithme de prédiction permettant au psychiatre d’identifier d’emblée, sur la base d’une simple prise de sang, le traitement qui aura le plus de chance d’être efficace pour son patient.

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